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宝诚生物助力安徽省阜阳市疾控中心顺利完成国内第一台MK1C测序仪装机测序
发表日期:2020-04-29

2020年4月19日至21日,宝诚生物完成了国内Nanopore新款测序仪MK1C在安徽省阜阳市疾病预防控制中心的装机任务。在3月27-28日,我公司就积极响应阜阳疾控中心关于尽快落实测序系统投入疫情防控的要求,提前投入了一台MinION测序仪,并进行了详细的实验和生信分析培训。由于前期已经过详细的培训,所以本次MK1C的装机过程非常顺利。 

在此特别感谢阜阳市疾控中心相领导、检验科卜科长、郭老师、张老师等对我们工作的支持。看到他们为了疫情防控追赶工作进度,检验科的老师吃住在单位,做到样本随到随做,这种忘我的实干精神深深感染了我们,我司技术支持也临时调整优化了安装培训方案,进行穿插式培训,每天与客户一起工作到凌晨1点多,得到了用户的充分肯定与好评。


 

在本次装机培训中心,阜阳疾控中心应用柏熠科技K0212新冠全基因组捕获试剂盒进行新冠病毒的全基因组捕获,SQK-LSK109 1D试剂盒连接法文库构建,成功完成了对新冠病毒样本的全基因组测序并上传BIGD国家基因组科学数据库,基因组覆盖度超过99.5%,为战疫推进做出自己的贡献。

 

实验结束之后老师表示Oxford Nanopore的MK1C测序仪的便携与实时性,该设备的投入使用,能大大加强他们对于本次新冠疫情的变异分析及溯源工作,同时对于常规检测无法确定的未知微生物致病源,可以很好地解决这个问题,提供很多检测方向的思路,鉴于目前的检测结果非常令人满意,他们表示马上开始下一批次样本的实验检测。

Nanopore测序具有实时性、长读长的特点,目前实际操作中读取的最长DNA片段长度大于2Mb。此外,nanopore可以直接测序DNA和RNA,不需要PCR扩增,使得测序无扩增偏差。而nanopore的文库制备简单,测序仪便携,可以携带至现场进行测序等特点,真正意义上做到了使任何人在任何地点都可以进行测序这样的理念。

Oxford Nanopore是一家技术型公司,公司针对通量大小推出以下测序产品,分别是:Flongle,MinION, MinION MK1C,GridION和 PromethION. 公司注重技术的开发,现有员工300余人,涉及多重学科和领域。针对不同的应用领域,Nanopore有不同的指导方案。现阶段,Nanopore测序仪在微生物耐病毒耐药性及致病性,环境研究,植物研究,癌症研究,临床研究,微生物组,转录组分析等领域都有大量的应用。

 

如需了解Nanopore测序仪的详细资料,请与我们联系。

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