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宝诚生物首席技术毛凌峰博士受邀在第三届国际兽医检测诊断大会做ONT测序应用报告
发表日期:2021-07-02
AVDC-China

  第三届国际兽医检测诊断大会暨亚洲兽用医疗器械及药品展览会625日在杭州盛大开幕。2021年第三届国际兽医检测诊断大会邀请了中国、美国、英国、荷兰、澳大利亚等10多个国家81位演讲嘉宾,在3天内分享92场主题报告,参会代表2398人。




现场展台

 现场共有参展商138家,其中重量级仪器耗材生产商参展商例如正大集团、世纪元亨、金诺百泰、美国伯乐、基、天隆科技、博日科技等皆有参展。可以看到兽医检测诊断会议绝大多数展品隶属于自动核酸提取仪及试剂、实时荧光定量仪及试剂、各种动物抗体原理检测试剂,以及其他类似离心机、移液器、管与枪头等分子实验室常用设备与耗材。

 宝诚生物作为Oxford Nanopore Technologies授权经销商与厂家共同参展。Nanopore纳米孔测序仪是全场唯一亮相的测序仪设备厂家,其他测序仪生厂商及其设备并未出现。作为全场唯一测序仪厂家的ONT受到许多参会人员的咨询与期待。




       Oxford Nanopore Technologies还在现场展示了其重磅产品——GridION

  GridION为中通量的三代测序仪,是一款极具成本效益的小型台式系统,提供按需测序,并带有集成实时数据处理功能。GridION具有同时或单独运行五张测序芯片的能力,可为繁忙的实验室和服务提供商提供经济高效的长读长实时纳米孔测序优势。集成的高性能数据处理减轻了对复杂IT基础架构的需求。





主题报告

 第三届国际兽医检测诊断大会邀请了中国、美国、英国、荷兰、澳大利亚等10多个国家81位演讲嘉宾。主题报告主要涉及:

 猪(猪流行性腹泻、蓝耳病、猪瘟诊断、猪丁型冠状病毒)

 禽(鸡重要呼吸道传染病、禽免疫抑制病、家禽诊断、空气样本检测病原、禽流感、禽腺病病毒)

 牛羊(牛结核病、牛病毒性腹泻、羊病诊断、结节性皮肤病、牛白血病病毒、犬新孢子虫、牛布鲁氏菌病)以及少数宠物类诊断领域。

 涉及诊断的演讲嘉宾使用技术大部分涵盖了病理切片、抗原抗体检测、实时荧光检测以及测序技术。

 其中一个比较可喜的现象是中国动物疫病预防控制中心的刘洋教授在演讲中展示了第三代纳米孔测序技术在快速检测(8h)、长度长以及宏基因组组装方面的优势,并且展示了ONT准确度98%的最新更新。可见目前社会对纳米孔测序技术的错误认识逐渐更正。



  我司毛凌峰博士在会议中分享纳米孔测序技术在动物疫病方面的应用,提高了纳米孔测序技术知名度,讲座结束后吸引了一大波感兴趣的潜在客户前往Oxford Nanopore Technologies展台。




 报告中毛博分享了利用纳米孔测序技术对非洲猪瘟(ASFV)进行快速全基因组测序的文章“Rapid Sequence-Based Characterization of African Swine Fever Virus by Use of the Oxford Nanopore MinION Sequence Sensing Device and a Companion Analysis Software Tool”。该研究重点介绍了Nanopore 测序技术与 ASF-FAST 软件的结合使用,目的是快速、实时地从诊断样本中分离出完整的 ASFV 基因组。



ASFV 实时分析软件流程图

     Nanopore 技术与 ASF-FAST软的使用,能够实时识别和表征 ASFV。通过将纳米孔技术与快速测序试剂盒结合使用,结合富集处理和自动化分析,该研究最早在测序开始后 6 分钟就成功识别了 ASFV 特异性序列读数,成功富集的高质量样本可以在测序开始后的 10 分钟内生成代表高达 100% 的基因组的可操作原始数据。




非洲猪瘟样本利用Nanopore测序最快在10分钟内获得全基因组覆盖序列



纳米孔测序和其他测序技术在ASFV检测时间对比

 目前PCR的检测速度更快且成本更低,因此它仍然是筛选样品的首选测试。但是测序具有更强的检测能力可以提供更丰富的数据,能够发现PCR检测无法提供的突变信息。与Sanger测序和NGS测序相比,Nanopore的速度优势是毋庸置疑的。 

 该研究表明,纳米孔技术是一种重要的工具,可用于在世界上许多地方和地区进行快速监测,这些地点和地区面临着 ASFV 的重大风险。纳米孔测序平台可在进行测试的地区、没有复杂基础设施的实验室以及现场直接使用,结合开发的 ASF-FAST 配套软件,可以在几分钟内获取数据。这对于疾病爆发时的有效应急管理至关重要,可以减少经济损失并加快疾病控制干预。





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