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PromethION 24 (P24) 和 PromethION 48 (P48) 设计的运行分别多达24和48个测序芯片。每个测序芯片能够独立运行,提供灵活的按需测序,以满足特定的实验需求。
PromethION测序仪是一台高通量Nanopore测序仪,分为P24与P48两个型号,分别允许单独或者同时运行多至24/48张测序芯片,每个通道之间互相独立,理论上可一次产生至多7/14Tb的数据量。PromethION包含测序以及分析处理模块,适合实验室构建公共平台使用。
1) 测序能力:可以单独或一起运行多至24/48张测序芯片,48小时内每张芯片可产生200Gb的碱基数据;
2) 读长:目前纳米孔测序单条序列最长读长记录>4Mb,具体测序读长与样本片段长度一致;
3) 测序时间/实时测序:纳米孔测序技术并没有严格意义上的单次运行时间,数据随测序运行而实时产出并保存在硬盘,故测序可随时停止;
4) 芯片重复利用:Nanopore测序技术凭借独有的纳米孔生物蛋白测序芯片,支持芯片清洗之后重复利用;
5) 直接RNA测序:纳米孔测序技术允许不经过反转录直接对RNA进行长度长测序并获得剪辑修饰信息;
6) 测序运行环境:温度范围:-5°C到 +40°C;测序环境要求:无;
7) 运行Ubuntu16的操作系统,具备liunx处理的批量、高效的特点,又提供可视化的操作界面;
8) 通过网络连接,实现芯片的质量控制、数据上传网络段分析;
9) 内置集成软件,MinKNOW,EPI2ME等软件可以进行快速高效的实时分析,快速知晓样本状态,实时开始和停止;
10)尺寸及重量,测序模块:W 590 mm,H 190 mm,D 430 mm,重28 kg;数据分析模块:W 178 mm,H 440 mm,D 470 mm,重25 kg
1. 基因组序列分析:大型基因组组装,群体基因组,遗传漂变,结构变异检测,SNVs等
2. 靶向测序:外显子测序,结构变异检测,SNVs,16S,18S
3. RNA测序:全长转录组分析,可变剪切分析,融合基因检测,直接RNA测序等
4. 微生物快速检测:宏基因组检测,菌种鉴定组装,致病菌鉴定组装,抗生素耐药基因分析,以上均可快至6小时
5. 表观遗传方向:各种碱基修饰检测,支持4mC、5mC\5hmC、6mA等